在使用棒状薄层色谱仪时，一般情况是设定好各自分析参数，按照操作步骤开机使用即可。如果较长时间不使用则需用防潮防尘罩将色谱仪器覆盖，并切断电源，如果忽略这些注意事项可能造成FID检测器落聚灰尘而无法点火成功。这时需要清除掉灰尘，再顺次调节空气、氢气流路控制阀，如果无论怎么样调节仪器前后稳压阀或稳流阀，空气气体流量都不能上升至预定值（一般使用范围在1500～2000ml/min），即可认为是空气流量太小或流量无法调节故障。
当棒状薄层色谱仪出现此类故障时可进行如下操作排除故障：
1、 直观检查
首先打开仪器检查整个系统是否有明显的漏气声。如果听不到漏气声则转入3进行。
2、 查漏
听到有漏气声之后，可依照声音发出的方向逐步定位。此时可利用皂液的涂抹进一步确定漏气的发出。找到地方及时堵漏。
3、 柱前压观察
观察柱前压指示表的数值大小，可迅速判断是气源引起的故障还是仪器内部气路堵塞造成的。如果是柱前压太低说明空气发生器需要检测，如果柱前压正常则需要检测仪器内部气路。
4、 过滤器堵塞及稳压阀检查
将过滤器出口到仪器气源入口处的接头缓慢旋开，观察是否有较强的气流从接头处跑出。如有，则说明过滤器未堵塞，稳压阀可能有问题。在确定稳压阀不出气后，可进行拆卸与清洗，这可能是稳压阀内阀针与阀座间堵塞所致。如清洗后阀仍不能正常工作，最好换一个新阀；在上面试验中若无较强气流从旋开的接头中流出，需要检查过滤器出入口前后可能堵塞之处；
5、 减压阀修理
在证明减压阀故障之后，可拆卸修理减压阀。由于减压阀入口一侧有高压，因此如无修理经验，最好不要盲目拆卸，建议换用新减压阀。
6 、稳流阀的检测与修理
将仪器前面的稳流阀拆下，观察流量计中转子是否能上升到最上端。如果可以说明稳流阀前气路正常；如果不能说明柱前气路有泄露，进行7检查。
7、 检查流量传感器
通过前面1～6项检查，如排除空气发生器、减压阀、稳流阀故障将接回原气路中后，再调节各个阀仍无法显示空气流量最大值或最小值，这时要考虑流量传感器问题了。
8、 流量传感器问题排除
在通过7判断后，认为减压阀、稳流阀及空气发生器都没有问题后，重点检查流量传感器是否泄漏或损坏。如是作为精密传感器本身无法修理，需让厂家专业技术人员上门维修或寄回厂家修理更换。
9、流量阀与管理泄漏
用分段试堵法，将很快判定是否流量管理产生了泄漏。如有，按气路管路的清洗进行；如流量计前管路正常，可拆卸流量控制阀进行清洗。
