气相色谱仪分析柱分填充柱和毛细管柱。填充柱的填料可以是多孔性粒状系缚剂或在惰性载体颗粒表面均匀的涂敷一层很薄的固定液膜，填充柱常用内径2-5mm，长0.5-10m的金属管或玻璃管。填充柱制备简单，可供选用的载体、固定液、吸附集种类很多，因而具有广泛的选择性，有利于解决各种各样组分的分离分析问题，应用比较普遍。此外，填充柱的样品负荷量大，可用于制备色谱其缺点是柱渗透性较小，传质阻力较大，柱子不能过长，因而分离效率较低。柱效的选择问题，视试样组分而定，许多分析并不需要很高的分离效率，因此填充柱仍有其广泛的应用前景。如工业废水中硝基苯的分析、苯系物的分析等用填充柱气相色谱法足以满足分析要求，而现在的填充柱一般只用于气体的分析中。
毛细管柱则又可分为空心毛细管柱和填充毛细管柱两种。空心毛细管柱是将固定液直接涂在内径只有0.05mm的玻璃或金属毛细管的内壁上，毛细管柱是近几年才发展起来的，它是将某些多孔性固体颗粒装入厚壁玻管中，然后加热拉制成毛细管，一般内径为0.25～0.5mm。
毛细管气相色谱为什么比填充柱气相色谱柱效高
1、毛细管柱气相色谱仪比填充柱色谱前面多了一个分流/不分流装置；
2、柱后多了一个尾吹气路；
3、增加分流/不分流是为了防止毛细管柱（玻璃材质）超负荷；
4、通过分流可以让气化室的样品很少一部分进入柱子，其余的被分流放空。以达到保护毛细管柱的目的；
5、尾吹可以减少从毛细管柱流出物质在柱后的“停留”时间，保证载气流量和减小样品通过柱子的时间，从而提高效率。
填充柱加长柱长使分析时间加长，那毛细管住不会吗？
1、在相同的条件下，不论增加填充柱还是毛细柱的长度，分析时间都会比没有增加前加长；
2、柱长增加，意味着在同样的流速下；
3、气化后的样品通过柱子的时间增大，到达检测器的时间增大，所以引起保留时间升高。
